重磅 | 开云(中国)Kaiyun战疫利器MAPMI病原微生物检测全面升级
日期:2020-04-06 来源:

      近日,开云(中国)Kaiyun自主开发的超广谱病原微生物 mNGS 检测服务MAPMITM(Metagenomic Analysis Pipeline for Microbial Identification)实现全面升级。升级后的MAPMITM全面覆盖细菌、真菌、病毒、寄生虫、毒力因子、耐药基因等32000余项检测指标,通过海量宏基因组数据检测感染病原体,实现感染性疾病病原体的快速、准确和全面鉴定,进而辅助临床针对感染进行精准诊疗。

      新冠肺炎疫情来势汹汹,牵动亿万国人的心,自武汉爆发以来,迅速在全国各地蔓延,疫情之严重、形势之紧迫都是前所未有的,基于宏基因组学的感染性疾病病原体分子检测技术在这次疫情防控中发挥了重要作用,2019年12月,MAPMITM率先检出来自武汉的新型冠状病毒样本,拉响全国疫情警报。

“硬核”技术  助力临床锁定感染源

      临床上可感染人的微生物种类繁多,涉及到病毒、细菌、真菌、寄生虫等,病原复杂、确诊率低、治疗局限是横亘在感染性疾病临床诊治中的三大难题。面对未知的临床感染,传统的培养法时间周期长、阳性率低,传统的分子检测方法指标数量有限且无法对新发、未知感染病原体进行鉴别。
      基于宏基因组学的感染性疾病病原体分子检测技术是传染病诊断领域中的新技术,使用宏基因组测序,使无偏倚的传染病超广谱病原体筛查成为可能,是传统病原体检测技术的重要补充和升级。在面对无法确定的传染病病原体种类或罕见病原体感染,传统的靶向性病原体检测技术无法检出时,基于宏基因组测序的无靶向超广谱病原体筛查就显得尤为重要。在新病原体的诊断、监测、跟踪以及溯源方面,宏基因组测序技术也具有关键作用。

“硬核”实力  打造抗疫防疫利器

      MAPMITM是开云(中国)Kaiyun在自有的BES4000高通量测序平台基础上,进一步研发出的可同时进行DNA和RNA测序的超广谱病原体筛查技术,该项技术不依赖于传统的微生物培养,可直接从少量痰液、咽拭子、外周血、组织、肺泡灌洗液、脑脊液等多种临床样本中检测病原体基因序列,快速、准确地判断致病病原体,MAPMITM尤其适用于临床疑难、未知感染的诊断。对于未来可能发生的新发突发未知病原体,MAPMITM也将发挥更加突出的作用。

      升级后的MAPMITM超广谱病原微生物 mNGS 检测,从原先的可以检测13854种病原体,一跃提升至32000余种指标:可检13000种病毒、14098种细菌、1500种真菌、300种寄生虫等病原微生物,检测范围更广,检测指标更丰富。实验室收到样本后,最快48小时即可出具检测报告,报告中体现数据详实的阳性病原体检测结果,进而辅助临床医生制定精准诊疗方案。

“硬核”系统  铸造重大疫情智慧监控天网

      此次疫情的爆发给国家带来了前所未有的巨大损失,生命安全和生物安全领域的重大科技成果是“国之重器”,疫病防控和公共卫生应急体系是国家战略体系的重要组成部分。为此,依托博奥在病原微生物精准诊断领域的丰富经验和技术积累,将大数据和新型传染源检测技术相结合,打造网络化、实时化、自动化的疫情监控预警救治和预后报告。实现“两个一”,即:一手数据联网、第一时间上报,从源头上杜绝瞒报、迟报现象的发生,让决策层随时掌握疫情的发展状况直至疫情结束,形成不留一处死角的智慧疫情监控“天网”。

      针对已知和未知病原微生物的芯片检测系统,将全面布局医院、第三方独立医学检验机构等数据采集终端,提供标准的检测数据传输和共享接口,一手诊断数据通过5G网络传输到“天网”系统,实现数据和信息自动上传共享以及大数据服务支撑,该系统将支持政府、疾控中心等部门面向全国全域式监控,进行病原体感染大数据的实时监测、分析和综合展示服务。

      未来,博奥将持续坚持自主创新,不断推出多种新型医疗健康技术产品和服务,积极落实各地卫生主管部门和医疗机构的广泛需求,持续为公共卫生应急和广大人民群众的生命安全、身体健康保驾护航。